南医大二附院图书馆是本院医学文献中心。图书馆建筑面积约100平方米，设有期刊电子阅览室，中外文书库。现有上网电脑6台。阅览室每天全天开放。

馆藏书刊以临床医学为收藏重点，目前纸质图书期刊2万余册，数据库联盟南医大图书馆116个。

本馆在借阅服务的基础上，和南医大图书馆联盟开展代查代检及原文传递服务；查收查引、查新服务；学科服务及定题服务；各类信息资源培训服务等。