南京医科大学第二附属医院麻醉科（始创于1984年） 是南京医科大学硕士、博士学位授予点。科室拥有结构合理的人才梯队：现有医生42人（正高级职称6人、副高级职称12人、主治医师14人、住院医师10人），其中博士8人、硕士28人、学士6人；护理团队80人。

科室配备现代化手术室32间（含杂交手术室2间）及配备15张床位的麻醉后复苏室（PACU），环境优良，设备先进。下辖临床麻醉、疼痛诊疗、无痛诊疗及PACU等部门，细分普外、心胸外科、神经外科、眼耳鼻喉、骨科、泌尿外科、手术室外麻醉、妇产儿麻醉及疼痛诊疗9个亚专业组，年手术麻醉量逾4.2万例。

科室积极推动技术创新与研究，多项工作处于领先地位：国内率先推广并实践老年衰弱患者围术期优化管理策略研究及心血管手术快通道拔管技术。院内率先承担并开展体外膜肺氧合（ECMO）技术。应用床旁重症超声技术，为急危重症患者提供快速、可视化的诊断与评估保障。科研实力雄厚，近年在研或完成国家自然科学基金项目8项、省市级科研项目10余项。多人入选“江苏省333高层次人才培养工程”和“六大人才高峰”培养对象。科研成果显著：多项被鉴定为国内先进水平，多次荣获国家级及江苏省级奖项；发表学术论文70余篇，其中40余篇被SCI收录。科室人员多次应邀赴美国、日本等国家进行学术交流与培训。