2015年5月9日，由国家消化疾病临床医学研究中心核心单位南京医科大学第二附属医院和牵头单位第四军医大学西京医院共同举办的“第2届肠病与粪菌移植学术会议暨国家消化疾病临床医学研究中心研讨会”在南京成功召开。来自全国数十家医院共300多人参会。  

本次学术会议由南京医科大学第二附属医院院长季国忠教授主持，中国工程院副院长、西京消化病医院院长樊代明院士组织召开并作了重要报告，南京医科大学校长沈洪兵教授在开幕式上致辞，中华消化学会主任委员杨云生教授、中华消化学会副主任委员吴开春教授、中华消化学会常委房静远教授、上海市第一人民医院院长王兴鹏教授作了精彩报告。厦门大学中山医院的任建林教授、天津医科大学总医院的王邦茂教授、第三军医大学大坪医院的陈东风教授、南京医科大学第二附属医院的张发明副教授、扬州市第一人民医院的王梅教授分享了粪菌移植治疗炎症性肠病的经验，南昌大学第一附属医院的祝荫教授分享了粪菌移植治疗重症急性胰腺炎的经验，上海儿童医院的张婷教授和华中科技大学同济医院的刘艳教授分享了粪菌移植治疗儿童肠道感染的经验，肯定了粪菌移植在成人和儿童复杂肠病及肠外疾病治疗中的价值。同时，南京医科大学第二附属医院肠病中心的张发明教授和彭炤源副主任医师在大会上分别报道肠病治疗新技术：经内镜肠道植管粪菌移植、肠镜下硬化治疗痔疮和直肠脱垂。

为了体现本次学术会议的创新、自由、广泛参与和百家争鸣，促进学术交流，增进与会人员对粪菌移植领域的了解，本次会议特在5月9日上午和下午前半场集中会议的基础上，开辟了《医学争鸣》研讨专场，就“临床决策与评估”和“粪菌移植方法学与细菌研究”两大问题分别进行深度研讨，到场专家踊跃发言，气氛热烈。